產(chǎn)品說明
外切核酸酶III作用于雙鏈 DNA,從 3′ OH 末端方向逐步切去單核苷酸。每次酶與底物結(jié)合催化,只有幾個核苷酸被除掉,從而在 DNA 分子群內(nèi)產(chǎn)生漸進(jìn)式3’端缺失。
盡管可以作用于雙鏈 DNA 的切刻產(chǎn)生單鏈缺口,但該酶最適底物是平齊末端或 3′ 凹陷末端 DNA。由于對單鏈 DNA 無活性,因此該酶無法切割 3′ 突出末端。3′ →5′ 外切酶活性對底物的切割程度隨 3′ 突出末端的長度而變化,四堿基或更長的突出末端完全不能被切割。
核酸外切酶 III 的活性部分依賴DNA雙螺旋結(jié)構(gòu),并根據(jù)序列的不同而有差異(C>A=T>G)。溫度、鹽濃度和酶與 DNA的比例對酶活性影響很大,應(yīng)根據(jù)不同的反應(yīng)調(diào)整反應(yīng)條件。
核酸外切酶 III 也有 RNase H、3′ -磷酸酶、脫嘌呤/嘧啶(AP)位點特異性核酸內(nèi)切酶活性。
本公司Exonuclease III是重組表達(dá),并經(jīng)多步純化制備的重組蛋白。
活性定義
1活性單位指在37℃條件下, 30 min內(nèi)催化生成1nmol酸可溶性總核苷酸所需的酶量。
活性測定條件
1×AM BufferA: 10 mM Bis-Tris,10 mM MgCl2,1 mM DTT(pH 7.0)
濃度:100U/μl
保存條件:-20℃可保存2年,避免反復(fù)凍融
特點與適用范圍
? 3′ →5′ 外切酶活性
? 雙鏈DNA的非定向巢式缺失
? RPA擴(kuò)增中熒光探針的降解,釋放熒光信號
? 制備用于雙脫氧測序的單鏈模板
產(chǎn)品包裝規(guī)格及組成
Component | AE2102A | AE2102B |
Exonuclease III | 2500U | 12500U |
10×AM Buffer A | 0.2ml | 1.0ml |
質(zhì)量控制
經(jīng)過嚴(yán)格的質(zhì)控檢測,確保該產(chǎn)品具有最高的活性和純度。
酶貯存緩沖液
200 mM KCl,5 mM KPO4,5 mM β-ME,0.05 mM EDTA,200 μg/ml BSA,50% Glycerol (pH 6.5@25℃)。
相關(guān)產(chǎn)品
AE2101: lambda exonuclease
應(yīng)用實例
1. 酶切反應(yīng)
1)按下表配制反應(yīng)體系
反應(yīng)組分 | 體積/ul |
10× Buffer | 5 |
平末端或5’突出端(3’ 凹陷末端)DNA | 2-5ug |
Exonuclease III (100U/μl) | 1 |
H2O | variable |
總體積 | 50 |
2)37°C反應(yīng)30min;
3)75°C加熱10min,使酶失活
4)電泳檢測雙鏈DNA水解結(jié)果。
2. RPA熒光釋放反應(yīng)
1)按下表配制反應(yīng)體系
反應(yīng)組分 | 體積/ul |
10 × RPA Buffer | 5 |
RPA Mix | Xul |
5 | |
RPA引物R(10uM) | 5 |
RPA熒光探針(10uM) | 1 |
Exonuclease III (100U/μl) | 1 |
H2O | variable |
總體積 | 50 |
2)在熒光檢測儀(qPCR儀)中37°C反應(yīng)15-60min;
3)觀測熒光曲線。
警告: 本產(chǎn)品僅限科研實驗使用,臨床應(yīng)用安全性和有效性未鑒定,不可用于醫(yī)療臨床診斷。
注意事項
l 核酸外切酶 III 不能切割硫代磷酸酯鍵。因此,也可以通過引入一個 α-硫代磷酸核苷酸將 DNA 分子的一端保護(hù)起來,以進(jìn)行單向切割。
l 這種特性可以用于對一端為鈍化末端(3′ 突出端),另一端是敏感末端(平端或 5′ 突出端)的線性 DNA 分子進(jìn)行單方向切割。
l 在如下Buffer中的活性為:AM Buffer 1:100%,AM Buffer 2:75%,AM Buffer 3:25%,AM Buffer 4:75%,AM Buffer 4.1:100%